《海国图志》在表达方式上，为了凸显环保的剧情主题，同时又让玩家更有参与感。最终选择了放置类游戏这一形式，玩家通过派遣角色外出探索，带回环境污染相关的情报。在体验游戏乐趣性的同时也能了解到环境污染带来的影响，增强人们的环保意识。
在整体风格的设计上将角色主要分成了：浅海和深海两个不同的生态圈。浅海依赖太阳与生物本身的能量，文明主要以绿色，清洁生态能源为主，城邦的建筑风格也更轻盈分散。而深海则是更多的依赖大地深层的能量，数不尽的热液喷泉与火山为他们提供了大量甲烷以及重金属。也因此深海城邦的建筑风格更为厚重，聚集，以金属材质为主。
序：
主角宁恩与他的家族世代生活在深海最大的城邦里。他们拥有一个极其辉煌的文明。他们有自己的宗教，自己的文字，自己的艺术，以及自己的，独立的政权。全世界的海底类似这样的城邦有很多，大大小小。城邦之间有相互的贸易往来，政治上的合作也不在少数。近百年由于几个最大的城邦达成和平共荣协议，除了偶尔有些局部纷争以外，整体局面都很和谐，各个小城邦也得益于此高速发展。
然而近年来，城邦里总是会发现一些漂浮的以白色为主的薄膜样的东西，这让作为城邦环境监察员的主角十分头疼，毕竟在他们的世界里貌似从未有过这种材质的物质。而且这种东西貌似还不能消化，经常有把他当做水母误食的居民因此住院。
这种非自然现象当然引起了上级的注意。再加上最近从浅海来的外交人员与他们交涉了关于浅海水源污染一事，也因此主角被派遣去调查此事。深海的东西几乎都是上面掉下来的，如果想查清这事，也许还得去他的源头——浅海看看……
因为浅海的居民不能随意去到深海，所以其实两边的来往并不是很密切，主角因为公事委派去往浅海，意外在城邦外的野地救起了一个因被人追捕而身受重伤的虎鲸。只是他的样貌有些许特别，这才发现浅海的污染远比他们收到的情报要严重得多……
